By 
Motegi – Pembalap dari tim Honda, Marc Marquez berhasil meraih kemenangan di home sirkuit Honda, Twin Ring Motegi, Jepang. Kemenangan ini juga menghantarkannya kepada gelar juara dunia MotoGP untuk ketiga kalinya sepanjang 4 tahun berada di ajang balap MotoGP.
Gelar juara dunia MotoGP 2016 ini didapatkannya karena duo Yamaha, Valentino Rossi dan Jorge Lorenzo terjatuh dan tidak dapat melanjutkan balapan. Dari dua pembalap Yamaha itu, Valentino Rossi yang pertama jatuh, 18 lap dari akhir balapan. Sedangkan Lorenzo terjatuh 5 lap jelang akhir balapan ketika berada di tempat kedua. Hasil ini membuat Marc Marquez mengumpulkan 273 poin, terpaut 77 poin dari rival terdekatnya, Valentino Rossi di tempat kedua klasemen MotoGP 2016.
Balapan MotoGP Jepang 2016 berakhir dengan posisi kedua diraih Andrea Dovizios dari tim Ducati dan Maverick Vinales di posisi ketiga.
Hasil MotoGP Jepang 2016
| Pos. | Points | Num. | Rider | Nation | Team | Bike | Km/h | Time/Gap |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 25 | 93 | Marc MARQUEZ | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 162.3 | 42’34.610 |
| 2 | 20 | 4 | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati Team | Ducati | 162.1 | +2.992 |
| 3 | 16 | 25 | Maverick VIÑALES | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 162.1 | +4.104 |
| 4 | 13 | 41 | Aleix ESPARGARO | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 162.0 | +4.726 |
| 5 | 11 | 35 | Cal CRUTCHLOW | GBR | LCR Honda | Honda | 161.4 | +15.049 |
| 6 | 10 | 44 | Pol ESPARGARO | SPA | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 161.1 | +19.654 |
| 7 | 9 | 19 | Alvaro BAUTISTA | SPA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 160.9 | +23.032 |
| 8 | 8 | 9 | Danilo PETRUCCI | ITA | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 160.5 | +28.555 |
| 9 | 7 | 45 | Scott REDDING | GBR | OCTO Pramac Yakhnich | Ducati | 160.5 | +28.802 |
| 10 | 6 | 6 | Stefan BRADL | GER | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 160.3 | +32.330 |
| 11 | 5 | 21 | Katsuyuki NAKASUGA | JPN | Yamalube Yamaha Factory Racing | Yamaha | 159.6 | +42.845 |
| 12 | 4 | 68 | Yonny HERNANDEZ | COL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 159.1 | +52.219 |
| 13 | 3 | 38 | Bradley SMITH | GBR | Monster Yamaha Tech 3 | Yamaha | 159.0 | +53.783 |
| 14 | 2 | 53 | Tito RABAT | SPA | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 158.9 | +54.760 |
| 15 | 1 | 73 | Hiroshi AOYAMA | JPN | Repsol Honda Team | Honda | 158.6 | +1’00.155 |
| 16 | 76 | Loris BAZ | FRA | Avintia Racing | Ducati | 158.3 | +1’04.440 | |
| 17 | 8 | Hector BARBERA | SPA | Ducati Team | Ducati | 156.0 | +1’42.966 | |
| 18 | 7 | Mike JONES | AUS | Avintia Racing | Ducati | 154.5 | 1 Lap | |
| Not Classified | ||||||||
| 99 | Jorge LORENZO | SPA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 162.3 | 5 Laps | ||
| 46 | Valentino ROSSI | ITA | Movistar Yamaha MotoGP | Yamaha | 161.3 | 18 Laps | ||
| 43 | Jack MILLER | AUS | Estrella Galicia 0,0 Marc VDS | Honda | 158.7 | 18 Laps | ||
| 50 | Eugene LAVERTY | IRL | Pull & Bear Aspar Team | Ducati | 153.3 | 22 Laps | ||
